南京中医药大学坚持“衷中参西，脑手结合，紧贴临床，注重人文”的实验教学理念，以中医理论为指导、中医临床能力培养为主线、现代医学技术为保障、模拟教学为手段，强化团队协作精神、医患沟通技能及创新能力，全面构建现代中医临床实验教学体系。
　　建设与管理：2007年学校以第一临床医学院省级实验教学示范中心“临床基础教学实验中心”为基础，将基础医学院中医诊断实验室及第二临床医学院针灸、推拿实验室进行整合，成立校级实验中心——南京中医药大学中医临床实验教学中心，2009年成功申报为国家级实验教学示范中心建设点。2011年，因教学改革需要，中心相继在江苏省苏州、昆山、无锡、南通、徐州、连云港、泰州市八家中医院筹建了“临床技能分中心”，形成以校本部实验中心为主体，临床八个分中心作为支撑“1+8”的建设模式。校本部对分中心建设进行管理指导，对临床实验教学人员进行定期培训。中心已建成“基本技能、专科技能、临床思维能力、研究创新能力”四个实验教学平台，在临床思维训练平台中研发了“中医诊断学全程多媒体辅助教学系统”、“模拟处方与方证辨识实训平台”及“中医临床辨治思维能力训练平台”，将临证思维过程有重点、有步骤地进行教学模拟。
　　中心由学校教务处统筹规划管理，实验中心主任负责制，对教学经费、实验室、教师、仪器等实行管理。实验室管理制度健全，维护经费足额到位，大型仪器有专人维护和管理，各分中心管理规范，为学生床边教学及临床医师规范化培训提供了有力保障，形成良好的管理运行机制。

    硬件与环境：中心实验室布局合理，环境整洁明亮，体现以人为本，严格执行国家安全、环保标准。建设以来，不断加强四个实验平台的软硬件建设，引进了“脉象仪”、“舌象仪”、“多功能针灸人”等中医教学模型及“高级综合模拟病人ECS”、“虚拟诊断实验系统”等西医教学设备。同时中心已建成网络化实验教学和综合管理平台，实现了网上辅助教学和网络化管理。
　　教学与改革：建设以来，中心不断进行实验教学改革，从整合实验课程、更新实验项目，到规范实验考核、加强质量监控，不但强化学生临床动手能力，更强调培养学生中医临证思维及创新能力，建立了操作、思维、创新及沟通交流四组课程模块，形成多层次、模块化的中医临床实验教学体系。
　　成效与特色：中心获得国家级、部省级教学科研成果奖23项，出版教材、论著87部，发表教研论文124篇；学生获省级及以上各类科技创新奖项85项。同时自主研发了外科模型人、中医诊断学习软件、临床思维能力训练平台等，形成了中心鲜明的特色。中心已成为中西医结合的教学平台、中医辨治论治的训练场所，中医文化的传承中心，在培养高素质中医人才中发挥重要作用。